公司变更股东时，股权转让属于重要环节，同时复杂的税务处理与之相关。个人股东也好，企业股东也罢，只有对不同身份所对应的税种、税率以及申报流程准确理解，才能够避免潜在税务风险，合规完成相关股权交易。每个参与股权转让的交易者均需掌握正确的税务处理方法，这是必备技能。
股权转让涉及哪些税种
股权转让所涉及的税种，因转让方身份存在差异而有所不同，对于个人转让股权情形而言，主要涉及个人所得税以及印花税，个人所得税依照“财产转让所得”适用百分之二十的比例税率，而印花税税率是股权转让合同所载金额的万分之五，由转让双方各自予以承担，倘若为企业转让股权，那么则需缴纳企业所得税以及印花税，企业所得税一般税率为百分之二十五，符合条件的小型微利企业或者高新技术企业能够享受优惠税率。需加以留意的是，并非上市的公司的股权进行转让，一般而言是不需要去缴纳增值税的，而这一税种主要是针对上市的公司的股票转让所设定的。
许多纳税人在实际操作里，容易将各不同税种的计税依据弄混淆，个人所得税应纳税额计算公式是，股权转让收入减去股权原值，再减去合理费用，之后乘以 20%的税率，印花税计税依据则是股权转让合同所列金额，不涵盖列明的认缴但尚未实际出资权益部分，对企业来讲，股权转让所得要并入企业收入总额计算企业所得税，不许扣掉被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权可能分配的金额。
个人股权转让如何计算个税
对于个人股权转让个人所得税的计算而言，其核心在于精准确定三大要素，这三大要素分别是，股权转让收入，股权原值以及合理费用。股权转让收入并非仅仅指转让协议上所标明的价格，它还涵盖转让方所获取的与股权转让相关的各类经济利益。倘若申报的股权转让收入显著偏低且不存在正当理由，那么税务机关便有权进行核定征收，而核定征收主要采用的是净资产核定法。特别需要留意的是，当被投资企业具备土地使用权，还有房屋，以及知识产权等资产，并且这些资产占到总资产的比例超出20%的时候，税务机关有可能会依照资产评估报告来核定股权转让收入。
股权原值的确定，依赖于取得股权的方式，以非货币性资产出资方式取得的股权，其原值按评估后的公允价值来确定，对于以现金出资式获取的股权，原值依照实际支付的价款以及相关税费予以确定，通过受让方式所得的股权，原值以购买股权的价款加上相关税费为准，对于多次取得同一被投资企业股权的情况，转让部分股权时刻采用“加权平均法”来确定其股权原值，合理费用指的是股权转让时按规定支付的有关税费，像是印花税、资产评估费等 。
股权转让收入偏低怎么办
在股权转让实践当中，转让收入明显偏低的情况经常会出现 ，拥有符合法定条件的低价转让 ，不会被税务机关调整 ，比如继承 ，或者将股权转让给配偶 ，或者转让给父母 ，或者转让给子女等近亲属 ，又或者能证明被投资企业因为国家政策调整 ，生产经营受到重大影响 ，还有相关法律规定 ，或者企业章程规定 ，并且有资料证明转让价格合理的内部转让等 ，在这些情形之下 ，即便转让收入明显偏低 ，也会被视为有正当理由 。
若股权转让收入偏低且并不归属上述正当理由范畴，税务机关便会启动核定程序 ，首要的核定方法乃是“净资产核定法，也就是依据每股净资产或者股权所对应的净资产份额来核定股权转让收入 ，比如 ，要是被转让企业的净资产为2000万元 ，个人股东转让50%的股份 ，转让合同价格是800万元 ，税务机关不会认可此价格 ，而是会按照1000万元核定转让收入 。企业拥有土地使用权，企业拥有房屋等特定资产，企业拥有的这些特定资产占比超过20%时，税务机关还可能参照中介机构出具的资产评估报告核定股权转让收入。
股权转让何时何地申报纳税
个人股权转让，其纳税义务发生时间，原则上是在转让协议生效之时，并且在完成股权变更手续的次日。纳税人应当在次月15日向主管税务机关申报纳税，扣缴义务人同样应当在次月15日向主管税务机关申报纳税。需要注意的是，纳税地点并非纳税人所在地，纳税地点也不是扣缴义务人所在地，纳税地点是被设定为被投资企业所在地的税务机关。这一规定常常被纳税人所忽略，进而导致出现错误申报的情况。
企业股权转让时，企业所得税确认时间点不一样，按相关规定，企业转让股权收入在转让协议生效，且完成股权变更手续时，才确认收入实现，企业计算股权转让所得时，不能扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权可能分配的金额，此规定避免了企业借股权转让变相分配利润逃避税款行为，企业要在年度企业所得税汇算清缴时申报缴纳股权转让所得企业所得税。
股权转让有哪些特殊税务处理
除了常规那种股权转让外，实践之中还存在着多种特殊情形，而这多种特殊情形是需要特殊税务处理的。企业重组里的股权收购，要是收购企业所购买的股权不低于被收购企业全部股权的百分之五十，并且股权支付金额不低于交易支付总额的百分之八十五，那就能够选择特殊性税务处理，也就是暂且不确认股权转让所得或者损失。另外，百分百直接控制的居民企业之间按照账面净值划转股权，要是具有合理商业目的，划出方企业以及划入方企业皆可以不确认所得。
个人进行以非货币性资产作为投资行为，这属于个人转让非货币性资产以及投资这两个行为同时发生的情况，对于个人转让非货币性资产所获取的所得，应当按照“财产转让所得”这个项目来计算并缴纳个人所得税。要是纳税人一次性缴纳税款存在困难，那么可以合理地确定分期缴纳的计划，在报主管税务机关备案之后，从发生上述应税行为的那一日开始，在不超过5个公历年度的时间范围内分期缴纳个人所得税。个人终止投资经营收回款项，从被投资企业那里取得的种种款项，都属于个人所得税应税收入。应依照“财产转让所得”项目来计算缴纳个人所得税 。
股权转让如何在线办理
鉴于税务信息化建设不断推进，现今有着众多地方达成了股权转让全流程线上办理，纳税人登录电子税务局后能够自行完成信息填报，进行资料上传，开展进度查询，实施纳税申报，完成税款缴纳等全流程操作，税务部门接收资料后，会流转至涉税审批部门予以审核，系统及时反馈审核结果，审核通过后的相关信息会推送至市场监管部门，大幅度提高了办理效率 。
税务机关一般会对股权变更所要用到的材料清单以及注意事项进行全面梳理，以此来保证线上办理能够顺利且有序地开展，从而方便纳税人能够“一次性阅知、一次性备齐” 。在办理进程当中，要是碰到资料填报不准确或者审核没有通过等状况，纳税人能够借助“征纳互动”平台、电话沟通等诸多方式获取“一对一”远程指导，进而助力高效达成信息补正、资料重传。办理在线上，不仅节省了时间，还省力不少，而且加强了风险管控，税务机关借助部门联动，对“事前申报辅导 - 事中过程监管 - 事后风险防控”闭环管理体系进行了优化。
在股权转让进程当中，你遭遇过哪些致使你感到困惑的税务方面的问题呢，或者有没有什么格外特别的经验打算与大家进行分享呢，若是出现欢迎在评论的区域留言展开交流，要是觉得这篇文章在某种程度上对你是有帮助作用的，请去点赞并且分享给更多有着此种需求的朋友呀！