独资股东以两万块钱卖掉公司，主要涉及个人所得税的缴纳问题。根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，财产转让所得应适用20%的比例税率。
一、确定应纳税所得额
首先，需要确定卖公司所得的两万块钱中，有多少是属于财产转让所得的应纳税所得额。这通常涉及到公司资产的评估、负债的清偿以及交易费用的扣除等。具体的应纳税所得额需要根据实际情况进行计算。
二、计算应纳税额
根据《中华人民共和国个人所得税法》第三条，财产转让所得适用比例税率，税率为百分之二十。因此，应纳税额等于应纳税所得额乘以20%。例如，如果应纳税所得额为两万块钱，那么应纳税额就是4000元。
三、税务申报与缴纳
根据《中华人民共和国个人所得税法》第十二条，纳税人取得财产转让所得，应按月或者按次计算个人所得税，并在次月十五日内向税务机关报送纳税申报表并缴纳税款。因此，在卖掉公司并确定应纳税额后，独资股东需要按照规定的时间向税务机关进行申报并缴纳相应的税款。
综上所述，独资股东在卖掉公司时，需要根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，计算并缴纳个人所得税。具体税额根据应纳税所得额和税率进行计算，并及时向税务机关进行申报和缴纳。